Para meter archivos .pk3 en base sigue los siguientes pasos:
1- Descarga el archivo.
2- Guárdalo en una carpeta que tengas a mano.
3- Descomprimelo en esa misma carpeta.
4- Copia y pega el o los archivos .pk3 en la carpeta base del juego.
-----> La carpeta base está en C:\Archivos de programa\LucasArts\Star Wars Jedi Knight Jedi Academy\GameData\Base
Esto vale para TODOS los archivos .pk3 como mapas, sables, skins, etc...
Nota: Si actualizas el juego a la versión 1.01 para probarla o para lo que sea haz una copia de la carpeta del juego y guárdala en otra carpeta que quieras para tener las dos versiones al alcance de la mano.
Un saludo.